HoloCamp: A hologenomic investigation of Campylobacter susceptibility in slow-growing chicken

Hovedmål: Å bruke et hologenomisk rammeverk for å bedre forstå rollen til vert-mikrobe interaksjoner i mottakelighet for Campylobacter-infeksjon hos hurtig- og saktevoksende kyllingraser.

Saktevoksende raser har høyere mottakelighet for Campylobacter-infeksjon, noe som har stor innvirkning på lønnsomhet og potensialer for zoonotisk overføring til forbrukere gjennom fjørfekjøtt. Ved å generere og analysere genomiske, transkriptomiske, metagenomiske og metatranskriptomiske sekvenseringsdata vil prosjektet gi banebrytende bidrag til vår forståelse av vert-mikrobe interaksjoner i kyllingtarmen, bestemme hvordan den metabolske kapasiteten til tarmmikrobiota bidrar til vekst i nærvær og fravær av Campylobacter, og potensielt utvikle en anvendt cecal mikrobiom transplantasjonsløsning for redusert Campylobacter-mottakelighet hos saktevoksende kyllinger.